5NO4 | Ribosome | date | Apr 10, 2017 |
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title | Rsga-Gdpnp Bound To The 30s Ribosomal Subunit (Rsga Assembly Intermediate With Us3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | J.P.Lopez-Alonso, T.Kaminishi, T.Kikuchi, Y.Hirata, I.Iturrioz, N A.Schedlbauer, Y.Hase, S.Goto, D.Kurita, A.Muto, S.Zhou, C.Naoe, D D.Gil-Carton, C.Takemoto, H.Himeno, P.Fucini, S.R.Connell | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 16s Ribosomal Rna Chain: A |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S3 Chain: C Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us3 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S4 Chain: D Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us4 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S5 Chain: E Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us5 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S6 Chain: F Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Bs6 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S7 Chain: G Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us7 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S8 Chain: H Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us8 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S9 Chain: I Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us9 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S10 Chain: J Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us10 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S11 Chain: K Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us11 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S12 Chain: L Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us12 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S13 Chain: M Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us13 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S14 Chain: N Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us14 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S15 Chain: O Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us15 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S16 Chain: P Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Bs16 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S17 Chain: Q Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us17 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S18 Chain: R Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Bs18 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S19 Chain: S Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Us19 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 30s Ribosomal Protein S20 Chain: T Synonym: Small Ribosomal Subunit Protein Bs20 |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Small Ribosomal Subunit Biogenesis Gtpase Rsga Chain: Z Ec: 3.6.1.- Engineered: Yes |
Organism_scientific: Escherichia Coli (Strain K12) Organism_taxid: 83333 Gene: Rsga, Engc, Yjeq, B4161, Jw4122 Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 469008 Expression_system_strain: Bl21(De3) Expression_system_vector_type: Plasmid Expression_system_plasmid: P7xnh3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 5.16 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | 2MG, 4OC, 5MC, G7M, GNP, MA6, MG, PSU, UR3, ZN | enzyme | Hydrolase E.C.3.6.1 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | RsgA couples the maturation state of the 30S ribosomal decoding center to activation of its GTPase pocket., Lopez-Alonso JP, Kaminishi T, Kikuchi T, Hirata Y, Iturrioz I, Dhimole N, Schedlbauer A, Hase Y, Goto S, Kurita D, Muto A, Zhou S, Naoe C, Mills DJ, Gil-Carton D, Takemoto C, Himeno H, Fucini P, Connell SR, Nucleic Acids Res. 2017 May 8. doi: 10.1093/nar/gkx324. PMID:28482099 |
Data retrieval |
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