5O60 | Ribosome | date | Jun 02, 2017 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
title | Structure Of The 50s Large Ribosomal Subunit From Mycobacter Smegmatis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | J.Hentschel, C.Burnside, I.Mignot, M.Leibundgut, D.Boehringer, N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein Bl37 Chain: 3 Synonym: Bl37 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Rrna Chain: A |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Rrna Chain: B |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2 Chain: C Synonym: Ul2 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3 Chain: D Synonym: Ul3 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4 Chain: E Synonym: Ul4 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5 Chain: F Synonym: Ul5 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6 Chain: G Synonym: Ul6 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L9 Chain: H Synonym: Bl9 Other_details: Residues 44 To 73 Modeled As Poly-Alanine |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10 Chain: I Synonym: Ul10 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L11 Chain: J Synonym: Ul11 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13 Chain: K Synonym: Ul13 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14 Chain: L Synonym: Ul14 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15 Chain: M Synonym: Ul15 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L16 Chain: N Synonym: Ul16 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L17 Chain: O Synonym: Bl17 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18 Chain: P Synonym: Ul18 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19 Chain: Q Synonym: Bl19 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L20 Chain: R Synonym: Bl20 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21 Chain: S Synonym: Bl21 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22 Chain: T Synonym: Ul22 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23 Chain: U Synonym: Ul23 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24 Chain: V Synonym: Ul24 Other_details: Residues 48 To 55 Not Modeled |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L25 Chain: W Synonym: Bl25,General Stress Protein Ctc |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L27 Chain: X Synonym: Bl27 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L28 Chain: Y Synonym: Bl28 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29 Chain: Z Synonym: Ul29 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30 Chain: a Synonym: Ul30 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32 Chain: b Synonym: Bl32 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L33 1 Chain: c Synonym: Bl33 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L34 Chain: d Synonym: Bl34 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L35 Chain: e Synonym: Bl35 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L36 Chain: f Synonym: Bl36 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L31 Chain: g Synonym: Bl31 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Trna Cca-End Acetylated (Phe) Chain: 2 Other_details: Trna Cca Polyribonucleotid, Acetylated (Phe) |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis Str. Mc2 155 Organism_taxid: 246196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
crystal cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
method | Electron Microscopy | resolution | 3.20 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | MG, PHE, ZN | enzyme |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary reference | The Complete Structure of the Mycobacterium smegmatis 70S Ribosome., Hentschel J, Burnside C, Mignot I, Leibundgut M, Boehringer D, Ban N, Cell Rep. 2017 Jul 5;20(1):149-160. doi: 10.1016/j.celrep.2017.06.029. PMID:28683309 |
Data retrieval |
View 5O60 in 3D |
Visual 3D analysis of 5O60 |
Structure-derived information |
Sequence-derived information |
Other resources with information on 5O60 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |