5OPT | Ribosome | date | Aug 10, 2017 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
title | Structure Of Ksrp In Context Of Trypanosoma Cruzi 40s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | J.Brito Querido, E.Mancera-Martinez, Q.Vicens, A.Bochler, J.Chic A.Simonetti, Y.Hashem | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Activated Protein Kinase C Receptor, Putative Chain: p Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053511211.120, Tc00.1047053511211.130 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S29, Putative Chain: q Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053506025.14, Tc00.1047053511209.54, Tc00.1047053511805.15; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S16, Putative Chain: r Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053503899.20, Tc00.1047053503899.30 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S15, Putative Chain: t Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053511809.130, Tc00.1047053511809.99, Tc00.1047053511811.10; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S18, Putative Chain: u Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053506679.100, Tc00.1047053506679.94 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S4 Chain: L Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053509683.117, Tc00.1047053511051.39, Tc00.1047053511051.50; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S23, Putative Chain: M Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053504181.20, Tc00.1047053504181.30, Tc00.1047053509695.180, Tc00.1047053509695.184; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S5, Putative Chain: O Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053506297.150, Tc00.1047053506297.160 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S7, Putative Chain: Q Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053506593.30 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S13, Putative Chain: R Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053511291.90 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S27, Putative Chain: S Synonym: Ribosomal Protein S27,Putative Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053506963.14, Tc00.1047053511233.14, Tc00.1047053511277.175; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S26 Chain: T Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053503801.20, Tc00.1047053508817.60 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S33, Putative Chain: U Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053511237.60 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S14, Putative Chain: V Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053409117.20, Tc00.1047053506945.230, Tc00.1047053508823.50; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S3a-2 Chain: W Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053511001.9, Tc00.1047053511001.18 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S11, Putative Chain: X Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053508319.70, Tc00.1047053508405.40 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S24 Chain: Y Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053507681.150, Tc00.1047053507681.160 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S8 Chain: Z Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053511903.110 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S9, Putative Chain: b Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053504163.30, Tc00.1047053506401.120 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein Sa Chain: f Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053510425.19 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S2, Putative Chain: d Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053503833.40, Tc00.1047053506213.60, Tc00.1047053511287.120, Tc00.1047053511287.40; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S15a, Putative Chain: e Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053506297.330 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S21, Putative Chain: g Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053510101.420 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S25, Putative Chain: a Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053504105.94, Tc00.1047053509233.190 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S12 Chain: I Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053503395.50, Tc00.1047053506181.59 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ubiquitinribosomal Protein S27a, Putative Chain: j Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053510409.39 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S6 Chain: P Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053510769.49 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S17, Putative Chain: k Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053508827.70 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S20, Putative Chain: l Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053508475.10, Tc00.1047053508823.120, Tc00.1047053508823.140; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S3, Putative Chain: m Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053504021.109, Tc00.1047053507677.39, Tc00.1047053509353.30; Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S10, Putative Chain: n Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053506679.140, Tc00.1047053506679.150 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosomal Protein S19, Putative Chain: o Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053510879.20 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 40s Ribosomal Protein S30 Chain: c Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053507019.83, Tc00.1047053507019.86 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna-Binding Protein, Putative Chain: h Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi (Strain Cl Brener) Organism_taxid: 353153 Strain: Cl Brener Gene: Tc00.1047053511727.270 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 18s Rrna Chain: E Engineered: Yes |
Organism_scientific: Trypanosoma Cruzi Organism_taxid: 353153 Expression_system: Trypanosoma Cruzi Expression_system_taxid: 5693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
crystal cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
method | Electron Microscopy | resolution | 4.00 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary reference | The cryo-EM Structure of a Novel 40S Kinetoplastid-Specific Ribosomal Protein., Brito Querido J, Mancera-Martinez E, Vicens Q, Bochler A, Chicher J, Simonetti A, Hashem Y, Structure. 2017 Oct 13. pii: S0969-2126(17)30305-2. doi:, 10.1016/j.str.2017.09.014. PMID:29107485 |
Data retrieval |
View 5OPT in 3D |
Visual 3D analysis of 5OPT |
Structure-derived information |
Sequence-derived information |
Other resources with information on 5OPT |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |