5W5Y | Transcription | date | Jun 16, 2017 |
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title | Rna Polymerase I Initial Transcribing Complex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | Y.Han, Y.He | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa190 Chain: A Synonym: Dna-Directed Rna Polymerase I 190 Kda Polypeptide, Directed Rna Polymerase I Largest Subunit; Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa135 Chain: B Synonym: Dna-Directed Rna Polymerase I 135 Kda Polypeptide, Directed Rna Polymerase I Polypeptide 2,Rna Polymerase I Su Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I And III Subunit Rp Chain: C Synonym: Rna Polymerases I And III Subunit Ac1,C37,Dna-Dire Polymerases I And III 40 Kda Polypeptide,C40; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa14 Chain: D Synonym: A14,Dna-Directed Rna Polymerase I 14 Kda Polypepti |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: E Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc1,Abc27,Dn Rna Polymerases I,And III 27 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: F Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc2,Abc23,Dn Rna Polymerases I,And III 23 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa43 Chain: G Synonym: A43,Dna-Directed Dna-Dependent Rna Polymerase 36 K Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: H Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc3,Abc14.4, Dna-Directed Rna Polymerases I,And III 14.5 Kda Polypeptide |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa12 Chain: I Synonym: A12,A12.2,Dna-Directed Rna Polymerase I 13.7 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: J Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc5,Abc10-Be Dna-Directed Rna Polymerases I,And III 8.3 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I And III Subunit Rp Chain: K Synonym: Rna Polymerases I And III Subunit Ac2,Ac19,Dna-Dir Polymerases I And III 16 Kda Polypeptide,Rpa19; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: L Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc4,Abc10-Al |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa49 Chain: M Synonym: A49,Dna-Directed Rna Polymerase I 49 Kda Polypepti |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa34 Chain: N Synonym: A34,Dna-Directed Dna-Dependent Rna Polymerase 34.5 Polypeptide,A34.5; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna Polymerase I-Specific Transcription Initiatio Rrn6; Chain: O Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c Gene: Rrn6, Ybl014c, Ybl0311, Ybl0312 Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna Polymerase I-Specific Transcription Initiatio Rrn7; Chain: P Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c Gene: Rrn7, Yjl025w, J1273 Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna Polymerase I-Specific Transcription Initiatio Rrn11; Chain: Q Engineered: Yes |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 559292 Strain: Atcc 204508 S288c Gene: Rrn11, Yml043c, Ym9827.09c Expression_system: Escherichia Coli Expression_system_taxid: 562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna Chain: R Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae S288c Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Non-Template Strand Dna Chain: S Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae S288c Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Template Strand Dna Chain: T Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae S288c Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 3.80 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | ZN | enzyme | Transferase E.C.2.7.7.6 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Structural mechanism of ATP-independent transcription initiation by RNA polymerase I., Han Y, Yan C, Nguyen THD, Jackobel AJ, Ivanov I, Knutson BA, He Y, Elife. 2017 Jun 17;6. pii: e27414. doi: 10.7554/eLife.27414. PMID:28623663 |
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