5XYM | Ribosome | date | Jul 09, 2017 |
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title | Large Subunit Of Mycobacterium Smegmatis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | Z.Li, X.Ge, Y.Zhang, L.Zheng, S.Sanyal, N.Gao | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32 Chain Synonym: Bl32 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L33 2 Chain: 1 Synonym: Bl33 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L34 Chain: 2 Synonym: Bl34 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L35 Chain: 3 Synonym: Bl35 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L36 Chain: 4 Synonym: Bl36 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Rna Chain: A |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Rna Chain: B |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2 Chain: C Synonym: Ul2 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3 Chain: D Synonym: Ul3 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4 Chain: E Synonym: Ul4 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5 Chain: F Synonym: Ul5 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6 Chain: G Synonym: Ul6 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L9 Chain: H Synonym: Bl9 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13 Chain: J Synonym: Ul13 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14 Chain: K Synonym: Ul14 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15 Chain: L Synonym: Ul15 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L16 Chain: M Synonym: Ul16 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L17 Chain: N Synonym: Bl17 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18 Chain: O Synonym: Ul18 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19 Chain: P Synonym: Bl19 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L20 Chain: Q Synonym: Bl20 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21 Chain: R Synonym: Bl21 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22 Chain: S Synonym: Ul22 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23 Chain: T Synonym: Ul23 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24 Chain: U Synonym: Ul24 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L25 Chain: V Synonym: Bl25 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L27 Chain: W Synonym: Bl27 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L28 Chain: X Synonym: Bl28 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29 Chain: Y Synonym: Ul29 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30 Chain: Z Synonym: Ul30 |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Uncharacterized Protein Bl37 Chain: a |
Organism_scientific: Mycobacterium Smegmatis (Strain Atcc 7 Mc(2)155); Organism_taxid: 246196 Strain: Atcc 700084 Mc(2)155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 3.08 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | MG | enzyme |
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Gene Ontology |
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Primary reference | Cryo-EM structure of Mycobacterium smegmatis ribosome reveals two unidentified ribosomal proteins close to the functional centers., Li Z, Ge X, Zhang Y, Zheng L, Sanyal S, Gao N, Protein Cell. 2017 Sep 5. doi: 10.1007/s13238-017-0456-9. PMID:28875450 |
Data retrieval |
View 5XYM in 3D |
Visual 3D analysis of 5XYM |
Structure-derived information |
Sequence-derived information |
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