6EPE | Hydrolase | date | Oct 11, 2017 |
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title | Substrate Processing State 26s Proteasome (Sps2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | Q.Guo, C.Lehmer, A.Martinez-Sanchez, T.Rudack, F.Beck, H.Hartmann M.S.Hipp, F.U.Hartl, D.Edbauer, W.Baumeister, R.Fernandez-Busna | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-6 Chain: A Synonym: Macropain Iota Chain,Multicatalytic Endopeptidase Iota Chain,Proteasome Iota Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-2 Chain: B Synonym: Macropain Subunit C3,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C3,Proteasome Component C3; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Norway Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-4 Chain: C Synonym: Macropain Subunit C9,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C9,Proteasome Component C9,Proteasome Subunit L; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-7 Chain: D Synonym: Proteasome Subunit Rc6-1 Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-5 Chain: E Synonym: Macropain Zeta Chain,Multicatalytic Endopeptidase Zeta Chain,Proteasome Zeta Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-1 Chain: F Synonym: Macropain Subunit C2,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C2,Proteasome Component C2,Proteasome Nu Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Alpha Type-3 Chain: G Synonym: Macropain Subunit C8,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C8,Proteasome Component C8,Proteasome Subunit K; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-6 Chain: 1 Synonym: Macropain Delta Chain,Multicatalytic Endopeptidase Delta Chain,Proteasome Chain 5,Proteasome Delta Chain,Prote Subunit Y; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-7 Chain: 2 Synonym: Macropain Chain Z,Multicatalytic Endopeptidase Com Z,Proteasome Subunit Z; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-3 Chain: 3 Synonym: Proteasome Chain 13,Proteasome Component C10-II,Pr Theta Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-2 Chain: 4 Synonym: Macropain Subunit C7-I,Multicatalytic Endopeptidas Subunit C7-I,Proteasome Component C7-I; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-5 Chain: 5 Synonym: Macropain Epsilon Chain,Multicatalytic Endopeptida Epsilon Chain,Proteasome Chain 6,Proteasome Epsilon Chain,P Subunit X; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-1 Chain: 6 Synonym: Macropain Subunit C5,Multicatalytic Endopeptidase Subunit C5,Proteasome Component C5,Proteasome Gamma Chain; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome Subunit Beta Type-4 Chain: 7 Synonym: Macropain Beta Chain,Multicatalytic Endopeptidase Beta Chain,Proteasome Beta Chain,Proteasome Chain 3,Rn3; Ec: 3.4.25.1 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Subunit S5a Chain: W Synonym: Psmd4 Protein |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome (Prosome, Macropain) 26s Subunit, Non- 14; Chain: V Synonym: Proteasome 26s Subunit,Non-Atpase 14,Psmd14 Protei Rcg26455,Isoform Cra_b; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome 26s Subunit, Non-Atpase 8 Chain: T |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rcg28037 Chain: Y Synonym: Sem1,26s Proteasome Complex Subunit |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 2 Chain: Z |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 1 Chain: N Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn2,26s Proteas Regulatory Subunit S1,26s Proteasome Subunit P112; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome (Prosome, Macropain) 26s Subunit, Non- Chain: S Synonym: Proteasome (Prosome,Macropain) 26s Subunit,Non-Atp Isoform Cra_b,Proteasome 26s Subunit,Non-Atpase 3; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome (Prosome, Macropain) 26s Subunit, Non- 12; Chain: P Synonym: Proteasome 26s Subunit,Non-Atpase 12 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 11 Chain: Q Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn6 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome (Prosome, Macropain) 26s Subunit, Non- Chain: R Synonym: Proteasome (Prosome,Macropain) 26s Subunit,Non-Atp Isoform Cra_a,Proteasome 26s Subunit,Non-Atpase 6; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome (Prosome, Macropain) 26s Subunit, Non- (Predicted); Chain: U Synonym: Proteasome 26s Subunit,Non-Atpase 7 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Non-Atpase Regulatory Subunit 13 Chain: O Synonym: 26s Proteasome Regulatory Subunit Rpn9,26s Proteas Regulatory Subunit S11,26s Proteasome Regulatory Subunit P4 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Regulatory Subunit 7 Chain: H Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt1,Proteasome Subunit Atpase 2,Protein Mss1; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Regulatory Subunit 4 Chain: I Synonym: P26s4,26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt2,Prote Subunit Atpase 1; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Regulatory Subunit 6b Chain: K Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt3,Proteasome Subunit Atpase 4,S6 Atpase,Tat-Binding Protein 7,Tbp-7; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Proteasome 26s Subunit, Atpase 6 Chain: L Synonym: Rcg61291 |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Regulatory Subunit 6a Chain: M Synonym: Proteasome (Prosome,Macropain) 26s Subunit,Atpase Cra_a; |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 26s Proteasome Regulatory Subunit 8 Chain: J Synonym: 26s Proteasome Aaa-Atpase Subunit Rpt6,Proteasome Subunit Atpase 5,Proteasome Subunit P45,Thyroid Hormone Rec Interacting Protein 1,Trip1,P45sug |
Organism_scientific: Rattus Norvegicus Organism_common: Rat Organism_taxid: 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 12.80 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | enzyme | Hydrolase E.C.3.4.25.1 BRENDA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | In Situ Structure of Neuronal C9orf72 Poly-GA Aggregates Reveals Proteasome Recruitment., Guo Q, Lehmer C, Martinez-Sanchez A, Rudack T, Beck F, Hartmann H, Perez-Berlanga M, Frottin F, Hipp MS, Hartl FU, Edbauer D, Baumeister W, Fernandez-Busnadiego R, Cell. 2018 Feb 8;172(4):696-705.e12. doi: 10.1016/j.cell.2017.12.030. Epub 2018, Feb 1. PMID:29398115 |
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