6EXV | Transcription | date | Nov 09, 2017 |
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title | Structure Of Mammalian Rna Polymerase II Elongation Complex By Alpha-Amanitin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | X.Liu, L.Farnung, C.Wigge, P.Cramer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase II Subunit Rpb1 Chain: A Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase II Subunit Rpb2 Chain: B Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase II Subunit Rpb3 Chain: C |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase II Subunit Rpb3 Chain: D |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: E |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: F |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase II Subunit Rpb7 Chain: G |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: H |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase II Subunit Rpb9 Chain: I Synonym: Rna Polymerase II Subunit B9,Dna-Directed Rna Poly Subunit I,Rna Polymerase II 14.5 Kda Subunit,Rpb14.5; |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: J Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc5,Dna-Dire Polymerase III Subunit L; |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: K |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: L |
Organism_scientific: Sus Scrofa Organism_common: Pig Organism_taxid: 9823 Tissue: Thymus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Amatoxin Chain: M |
Organism_scientific: Amanita Phalloides Organism_taxid: 67723 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna (25-Mer) Chain: N Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Synthetic Construct Organism_taxid: 32630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna (5'-R(Pcpapupapapapgpapcpcpapgpg Chain: P Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Synthetic Construct Organism_taxid: 32630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna (36-Mer) Chain: T Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Synthetic Construct Organism_taxid: 32630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 3.60 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | CSX, HYP, ILX, MG, TRX, ZN | enzyme | Transferase E.C.2.7.7.6 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Cryo-EM structure of a mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by alpha-amanitin., Liu X, Farnung L, Wigge C, Cramer P, J Biol Chem. 2018 Mar 17. pii: RA118.002545. doi: 10.1074/jbc.RA118.002545. PMID:29550768 |
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