6H68 | Transcription | date | Jul 26, 2018 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
title | Yeast Rna Polymerase I Elongation Complex Stalled By Cyclobu Pyrimidine Dimer (Cpd) With Fully-Ordered A49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | M.Sanz-Murillo, J.Xu, D.Gil-Carton, D.Wang, C.Fernandez-Tornero | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa190 Chain: A Synonym: Dna-Directed Rna Polymerase I 190 Kda Polypeptide, Directed Rna Polymerase I Largest Subunit; Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa135 Chain: B Synonym: Dna-Directed Rna Polymerase I 135 Kda Polypeptide, Directed Rna Polymerase I Polypeptide 2,Rna Polymerase I Su Ec: 2.7.7.6 |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I And III Subunit Rp Chain: C Synonym: Rna Polymerases I And III Subunit Ac1,C37,Dna-Dire Polymerases I And III 40 Kda Polypeptide,C40; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa14 Chain: D Synonym: A14,Dna-Directed Rna Polymerase I 14 Kda Polypepti |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: E Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc1,Abc27,Dn Rna Polymerases I,And III 27 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: F Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc2,Abc23,Dn Rna Polymerases I,And III 23 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa43 Chain: G Synonym: A43,Dna-Directed Dna-Dependent Rna Polymerase 36 K Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: H Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc3,Abc14.4, Dna-Directed Rna Polymerases I,And III 14.5 Kda Polypeptide |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa12 Chain: I Synonym: A12,A12.2,Dna-Directed Rna Polymerase I 13.7 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: J Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc5,Abc10-Be Dna-Directed Rna Polymerases I,And III 8.3 Kda Polypeptide; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I And III Subunit Rp Chain: K Synonym: Rna Polymerases I And III Subunit Ac2,Ac19,Dna-Dir Polymerases I And III 16 Kda Polypeptide,Rpa19; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerases I, II, And III Subun Chain: L Synonym: Rna Polymerases I,II,And III Subunit Abc4,Abc10-Al |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa49 Chain: M Synonym: A49,Dna-Directed Rna Polymerase I 49 Kda Polypepti |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Dna-Directed Rna Polymerase I Subunit Rpa34 Chain: N Synonym: A34,Dna-Directed Dna-Dependent Rna Polymerase 34.5 Polypeptide,A34.5; |
Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae (Strain Atcc S288c); Organism_taxid: 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna Chain: R Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Template Dna Chain: T Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Non-Template Dna Chain: U Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Saccharomyces Cerevisiae Organism_common: Baker'S Yeast Organism_taxid: 4932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
crystal cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
method | Electron Microscopy | resolution | 4.60 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | TTD, ZN | enzyme | Transferase E.C.2.7.7.6 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary reference | Structural basis of RNA polymerase I stalling at UV light-induced DNA damage., Sanz-Murillo M, Xu J, Belogurov GA, Calvo O, Gil-Carton D, Moreno-Morcillo M, Wang D, Fernandez-Tornero C, Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Aug 20. pii: 1802626115. doi:, 10.1073/pnas.1802626115. PMID:30127008 |
Data retrieval |
View 6H68 in 3D |
Visual 3D analysis of 6H68 |
Structure-derived information |
Sequence-derived information |
Other resources with information on 6H68 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |