5WS6 | Photosynthesis | date | Dec 05, 2016 |
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title | Native Xfel Structure Of Photosystem II (Preflash Two-Flash | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | M.Suga, J.R.Shen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II D1 Protein Chain: A, a |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Cp47 Reaction Center Protein Chain: B, b Synonym: Psii 47 Kda Protein,Protein Cp-47 |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Cp43 Chlorophyll Protein Chain: C, c |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II D2 Protein Chain: D, d Synonym: Psii D2 Protein,Photosystem Q(A) Protein Ec: 1.10.3.9 |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B559 Subunit Alpha Chain: E, e Synonym: Psii Reaction Center Subunit V |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome B559 Subunit Beta Chain: F, f Synonym: Psii Reaction Center Subunit Vi |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein H Chain: H, h Synonym: Psii-H |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein I Chain: I, I Synonym: Psii-I,Psii 4.4 Kda Protein |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein J Chain: J, j Synonym: Psii-J |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein K Chain: K, k |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein L Chain: L, l Synonym: Psii-L |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein M Chain: M, m |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Manganese-Stabilizing Polypeptide Chain: O, o Synonym: Msp |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein T Chain: T, t Synonym: Psii-Tc |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II 12 Kda Extrinsic Protein Chain: U, u Synonym: Ps II Complex 12 Kda Extrinsic Protein,Psii-U |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Cytochrome C-550 Chain: V, v Synonym: Cytochrome C550,Low-Potential Cytochrome C |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein X Chain: X, x |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein Ycf12 Chain: Y, y |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Reaction Center Protein Z Chain: Z, z Synonym: Psii-Z |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Photosystem II Protein Y Chain: R |
Organism_scientific: Thermosynechococcus Vulcanus Organism_taxid: 32053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 21 21 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 2.35 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | BCR, BCT, CA, CL, CLA, DGD, FE2, FME, GOL, HEC, HEM, HTG, LHG, LMG, LMT, MG, OEX, OEY, PHO, PL9, SQD, UNL | enzyme | Oxidoreductase E.C.1.10.3.9 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Light-induced structural changes and the site of O=O bond formation in PSII caught by XFEL., Suga M, Akita F, Sugahara M, Kubo M, Nakajima Y, Nakane T, Yamashita K, Umena Y, Nakabayashi M, Yamane T, Nakano T, Suzuki M, Masuda T, Inoue S, Kimura T, Nomura T, Yonekura S, Yu LJ, Sakamoto T, Motomura T, Chen JH, Kato Y, Noguchi T, Tono K, Joti Y, Kameshima T, Hatsui T, Nango E, Tanaka R, Naitow H, Matsuura Y, Yamashita A, Yamamoto M, Nureki O, Yabashi M, Ishikawa T, Iwata S, Shen JR, Nature. 2017 Mar 2;543(7643):131-135. doi: 10.1038/nature21400. Epub 2017 Feb 20. PMID:28219079 |
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