5MLC | Ribosome | date | Dec 06, 2016 |
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title | Cryo-Em Structure Of The Spinach Chloroplast Ribosome Reveal Location Of Plastid-Specific Ribosomal Proteins And Extensi | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | M.Graf, S.Arenz, P.Huter, A.Doenhoefer, J.Novacek, D.N.Wilson | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna, Chloroplastic Chain: A |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna, Chloroplastic Chain: B |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 4.8s Ribosomal Rna, Chloroplastic Chain: C |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2, Chloroplastic Chain: D Synonym: Ribosomal Protein Cs-L4 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3, Chloroplastic Chain: E |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4, Chloroplastic Chain: F Synonym: R-Protein L4 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5, Chloroplastic Chain: G |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6, Chloroplastic Chain: H |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L9, Chloroplastic Chain: I |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13, Chloroplastic Chain: L Synonym: Cl13 Other_details: Backbone Model Of The Nte. |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14, Chloroplastic Chain: M Synonym: Ribosomal Protein Cs-L29 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15, Chloroplastic Chain: N |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L16, Chloroplastic Chain: O Synonym: Ribosomal Protein Cs-L24 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L17, Chloroplastic Chain: P |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18, Chloroplastic Chain: Q |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19, Chloroplastic Chain: R Synonym: Cl19 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L20, Chloroplastic Chain: S |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21, Chloroplastic Chain: T Synonym: Cl21,Cs-L7 Other_details: Backbone Model Of The Nte. |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22, Chloroplastic Chain: U Synonym: Ribosomal Protein Cs-L13 Other_details: Backbone Model Of The Cte. |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23, Chloroplastic Chain: V Synonym: Prpl23 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24, Chloroplastic Chain: W Synonym: Cl24 Other_details: Backbone Model Of The Last Six Amino Acids. |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L27, Chloroplastic Chain: X |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L28, Chloroplastic Chain: Y |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29, Chloroplastic Chain: Z |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32, Chloroplastic Chain: 2 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L33, Chloroplastic Chain: 3 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L34, Chloroplastic Chain: 4 Synonym: Cl34 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L35, Chloroplastic Chain: 5 Synonym: Cl35 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L36, Chloroplastic Chain: 6 |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Ribosome-Recycling Factor, Chloroplastic Chain: 9 Synonym: Rrf,Cpfrr,Rrfhcp,Ribosome-Releasing Factor,Chlorop |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Psrp5alpha, Chloroplastic Chain: 7 Synonym: 50s Ribosomal Protein L40,Cl40,Plastid-Specific 50 Ribosomal Protein 5 Alpha,Psrp-5; |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Psrp6, Chloroplastic Chain: 8 Synonym: Cl25,Plastid-Specific 50s Ribosomal Protein 6,Psrp |
Organism_scientific: Spinacia Oleracea Organism_common: Spinach Organism_taxid: 3562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 3.90 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Cryo-EM structure of the spinach chloroplast ribosome reveals the location of plastid-specific ribosomal proteins and extensions., Graf M, Arenz S, Huter P, Donhofer A, Novacek J, Wilson DN, Nucleic Acids Res. 2016 Dec 15. pii: gkw1272. PMID:27986857 |
Data retrieval |
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Sequence-derived information |
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