1QVG | Ribosome | date | Aug 27, 2003 |
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title | Structure Of Cca Oligonucleotide Bound To The Trna Binding S The Large Ribosomal Subunit Of Haloarcula Marismortui | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | T.M.Schmeing, P.B.Moore, T.A.Steitz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna Chain |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna Chain: 9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Oligonucleotide Cca Chain: 3, 4, 5 Engineered: Yes |
Synthetic: Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2p Chain: A Synonym: Hmal2, Hl4 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3p Chain: B Synonym: Hmal3, Hl1 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4e Chain: C Synonym: Hmal4, Hl6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5p Chain: D Synonym: Hmal5, Hl13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6p Chain: E Synonym: Hmal6, Hl10 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L7ae Chain: F Synonym: Hs6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10e Chain: G Synonym: Acidic Ribosomal Protein P0 Homolog, Hmal10 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: L10 Ribosomal Protein Chain: H |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13p Chain: I |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14p Chain: J Synonym: Hmal13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15p Chain: K Synonym: Hmal15, Hl9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: L15 Ribosomal Protein Chain: L |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18p Chain: M Synonym: Hmal18, Hl12 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18e Chain: N Synonym: Hl29, L19 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19e Chain: O Synonym: Hmal19, Hl24 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21e Chain: P Synonym: Hl31 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22p Chain: Q Synonym: Hmal22, Hl23 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23p Chain: R Synonym: Hmal23, Hl25, L21 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24p Chain: S Synonym: Hmal24, Hl16, Hl15 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24e Chain: T Synonym: Hl21hl22 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29p Chain: U Synonym: Hmal29, Hl33 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30p Chain: V Synonym: Hmal30, Hl20, Hl16 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L31e Chain: W Synonym: L34, Hl30 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32e Chain: X Synonym: Hl5 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: L37ae 50s Ribosomal Protein Chain: Y |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37e Chain: Z Synonym: L35e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L39e Chain: 1 Synonym: Hl39e, Hl46e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L44e Chain: 2 Synonym: La, Hla |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: C 2 2 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 2.90 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | CD, CL, K, MG, NA | enzyme |
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related structures | by homologous chain: 1M90, 1Q81, 1YJ9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Structures of deacylated tRNA mimics bound to the E site of the large ribosomal subunit., Schmeing TM, Moore PB, Steitz TA, RNA 2003 Nov;9(11):1345-52. PMID:14561884 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |