1YJW | Ribosome Antibiotic | date | Jan 15, 2005 |
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title | Crystal Structure Of Quinupristin Bound To The G2099a Mutant Ribosomal Subunit Of Haloarcula Marismortui | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | D.Tu, G.Blaha, P.B.Moore, T.A.Steitz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 23s Ribosomal Rna Chain Mutation: Yes Other_details: Encoded By Rrna Operon |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37e Chain: 1 Synonym: L35e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L39e Chain: 2 Synonym: Hl39e,Hl46e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L44e Chain: 3 Synonym: Hla,La |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Quinupristin Chain: 4 Engineered: Yes |
Synthetic: Yes Organism_scientific: Streptomyces Graminofaciens Organism_taxid: 68212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 5s Ribosomal Rna Chain: 9 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L2 Chain: A Synonym: Hl4,Hmal2 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L3 Chain: B Synonym: Hl1,Hmal3 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L4 Chain: C Synonym: Hl6,Hmal4 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L5 Chain: D Synonym: Hl13,Hmal5 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L6 Chain: E Synonym: Hl10,Hmal6 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L7ae Chain: F Synonym: Hs6,Ribosomal Protein L8e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10 Chain: G Synonym: Acidic Ribosomal Protein P0 Homolog,Hmal10,L10e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L10e Chain: H |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L11 Chain: I Synonym: Hmal11 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L13 Chain: J Synonym: Hmal13 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L14 Chain: K Synonym: Hl27,Hmal14 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15 Chain: L Synonym: Hl9,Hmal15 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L15e Chain: M Synonym: 50s Ribosomal Protein Lc12 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18 Chain: N Synonym: Hl12,Hmal18 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L18e Chain: O Synonym: Hl29,L19 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L19e Chain: P Synonym: Hl24,Hmal19 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L21e Chain: Q Synonym: Hl31 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L22 Chain: R Synonym: Hl23,Hmal22 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L23 Chain: S Synonym: Hl25,Hmal23,L21 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24 Chain: T Synonym: Hl15,Hl16,Hmal24 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L24e Chain: U Synonym: Hl21hl22 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L29 Chain: V Synonym: Hl33,Hmal29 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L30 Chain: W Synonym: Hl16,Hl20,Hmal30 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L31e Chain: X Synonym: Hl30,L34 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L32e Chain: Y Synonym: Hl5 |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: 50s Ribosomal Protein L37ae Chain: Z Synonym: Ribosomal Protein L43e |
Organism_scientific: Haloarcula Marismortui Organism_taxid: 2238 Strain: Dt41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: C 2 2 21 |
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crystal cell |
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method | X-Ray Diffraction | resolution | 2.90 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | 004, 1MA, CD, CL, DBB, K, MG, MHT, MHU, MHV, MHW, NA, OMG, OMU, PSU, UR3 | enzyme |
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related structures | by homologous chain: 1M90, 1YIT, 1YJ9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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Primary reference | Structures of MLSBK antibiotics bound to mutated large ribosomal subunits provide a structural explanation for resistance., Tu D, Blaha G, Moore PB, Steitz TA, Cell. 2005 Apr 22;121(2):257-70. PMID:15851032 |
OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |